为规范昆明市科技型中小企业投资引导资金的财务管理工作，昆明市财政局制定了《昆明市科技型中小企业投资引导资金财务管理办法》。引导资金的使用管理遵循项目选择市场化、资金使用透明化的原则，科学管理，专款专用。在资金管理上，引导资金经费纳入市创新基金年度预算统一编制；在使用方式上，根据项目的不同特点，分别采取阶段参股、跟进投资、风险补助和投资保障的方式予以支持，在项目立项后一次或分次拨付；在退出方式上，一种是项目执行期满后退出，一种是项目执行期未满提前退出；在绩效管理上，由市科技局、市财政局委托第三方机构对引导资金的运作情况进行评估，对获得引导资金支持的投资机构的经费业绩进行绩效评价。